Vlivem zrychleného schvalování doprovodných zákonů k novému občanskému zákoníku došlo, spíše omylem, k zavedení poplatkové povinnosti za registraci a zápis změn u neziskových organizací. Jedná se o tisícikorunové částky za každý zápis, či změnu ve veřejném rejstříku, což například u větších organizací, s členitou strukturou pobočných spolků, činí v současné době mnohatisícové výdaje.
V pátek 26. září poslanci schválili změnu zákona o soudních poplatcích, která napravuje stav, kdy se neziskové organizace od ledna 2014 staly plátci soudních poplatků týkajících se zápisů do veřejného rejstříku. V případě prvozápisu nadace, nadačních fondů a zapsaných ústavů se jedná o poplatek dokonce 6000 Kč! Po schválení Senátem a podpisu prezidentem, bude změna okamžitě účinná. Osvobození od soudních poplatků a možnosti bezplatně upravit údaje ve veřejném rejstříku do souladu s novým Občanským zákoníkem, se neziskové organizace (spolky, nadace, nadační fondy, obecně prospěšné společnosti a ústavy) dočkají zhruba v období zimy 2014.
Nutno podotknout, že zmíněná zákonná úprava bude mít platnost omezenou pouze na 18 měsíců, což je předpokládaná doba na přijetí zákona o veřejné prospěšnosti. Následně bude osvobození od soudních poplatků pouze pro neziskové organizace se statutem veřejné prospěšnosti.
Schvalovací proces a plné znění novely zákona o soudních poplatcích, můžete sledovat na stránce Poslanecké sněmovny Parlamentu České republiky.